La CRSA s'organise autour d'une assemblée plénière, d'une commission permanente et de quatre commissions spécialisées :
La commission permanente
La commission spécialisée de la prévention
La commission spécialisée de l'organisation des soins
La commission spécialisée pour la prise en charge et l'accompagnement médico-sociaux
La commission spécialisée dans le domaine des droits des usagers du système de santé