L’année 2011 s’est inscrite dans la continuité de l’exercice 2010 qui a vu la mise en place d'une gestion régionalisée des enveloppes avec une campagne budgétaire désormais pilotée par l'Agence pour l'ensemble de la région :
- une dotation de 161 millions d'euros sur le secteur "personnes âgées",
- une dotation de 182 millions d'euros sur le secteur "handicap " et 29,6 millions d'euros pour les Etablissements t services d'aide par le travail (ESAT),
- plus d'1,1 milliard d'euros de financements sur le secteur "sanitaire".

Malgré un contexte budgétaire particulièrement contraint, la politique régionale a permis de soutenir notamment :

- sur le secteur sanitaire
• les plans de santé publique,
• les missions d'intérêt général
• l'accompagnement au retour à l'équilibre et des établissements en difficulté de trésorerie
• des projets régionaux (groupement régional de pharmacie, liaison hôpital-médecine de ville, systèmes d’information, espace éthique, financement des primes ou encore la culture à l’hôpital)

- Sur le secteur médico-social
• le financement de la médicalisation dans les EHPAD
• Les projets de coopération et de rapprochement d’établissements ou de gestionnaires
• La formation
• Les frais de transport
• Les projets d’accompagnement régionaux (liaison MAS/FAM avec la médecine de ville et le secteur sanitaire, la démarche qualité à travers le REQUA, gestion du temps de personnel soignant, appui dans la démarche d’infection associée aux soins, plate-forme de connaissance médico-sociale)

Pour autant, une approche des établissements par le seul prisme budgétaire serait insuffisante et incomplète. L'ARS doit s'attacher à parfaire la qualité de la prise en charge des personnes accueillies. Et en s'appuyant sur le postulat partagé que chaque euro doit aller prioritairement à la prise en charge des Francs-Comtois, il lui appartient de consolider son action au plus près des besoins de ses concitoyens.